能逃脱免疫的新奥密克戎亚变体-BW.1

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(新型冠状病毒)，在继续通过基因组突变进化。根据其传染性、毒性和逃避通过自然感染和疫苗接种诱导的免疫反应的能力，新出现的新型冠状病毒变异体已被分类为需留意变异体(VOI)和关切变异体(VOC)。

背景

目前，新型冠状病毒奥米克隆是世界上大多数国家流行的主要变异毒株。Omicron变异体的连续基因组突变导致了几个亚变异体的出现，从而显示了常规基因组监测的重要性。

一项新的研究发表在Research Square预印文本网站上*报告了BW.1 (BA.5.6.2.1)毒株有助于免疫逃逸，该毒株是BA.5.6.2谱系的一个亚变异体。

新型冠状病毒BW.1含有与BQ.1变异体相似的突变，有助于免疫逃逸。BQ.1是传播最迅速的谱系之一，包含几个突变，如S:K444T、S:L452R、S:N460K和S:F486V。

目前的研究，作者怀疑BW.1可能在7月初出现在墨西哥。到10月，BW.1是尤卡坦半岛的主要流行毒株。

新型冠状病毒基因组广泛测序，在拉丁美洲国家墨西哥是重点。先前的研究报告称，尤卡坦半岛是新型冠状病毒变种在墨西哥的主要入境路线之一，因为有相当大比例的游客涌入和商业活动。

关于研究

BQ.1、BA.5.6.2和BW.1的基因组序列和相关元数据从GISAID获得。2022年11月7日收集了所有相关的基因组序列，包括基于谱系信息的PANGO v.4.1.3。

BW.1及其亲本变体BA.5.6.2的基因组比对和系统发育重建分析是在Nextstrain的默认下使用多重序列比对(MSA)进行的。基因组比对有助于检测BW.1的突变，系统发育重建能够追溯到它们的起源。

主要发现

虽然疫情在BA.2/BA.5推动之后，墨西哥目前正处于低新冠肺炎发病率阶段，但过去几周从尤卡坦半岛收集的样本的基因组分析显示BW.1变异体呈广泛流行。

有趣的是，研究人员观察到，在10月份，尤卡坦半岛经历了新冠肺炎病例的激增。在此期间，BW.1变异体超过了该地区存在的其他新型冠状病毒变异体，包括其亲代变异体。

基因组分析强烈表明，BW.1可能起源于第五次流行高潮期间的墨西哥，并起源于据报告在该时期在尤卡坦州传播的BA.5.6.2菌株。更有趣的是，在从GISAID数据库收集的总共105个BW.1基因组序列中，有95个是在墨西哥收集的。

BW.1的两个同义替换追溯到BA.5.6.2基因组的墨西哥序列。仅检测到两种突变，将墨西哥BA.5.6.2与世界其他地方发现的Omicron毒株区分开来。核苷酸转换T7666C存在于全球2458个序列和所有BA.5.6.2序列的82.48%，在墨西哥BA.5.6.2基因组包括BW.1却不存在。

对墨西哥基因组序列的分析显示，BA.5.6.2和BW.1序列共享同义替换C14599T，这在世界其他地方的BA.5.6.2序列中仅存在4%。

BW.1的大多数基因组序列通过两点突变与亲本BA.5.6.2不同。在BW.1的98.09%和92.38%基因中分别观察到核苷酸转换G2144A和颠换T22942G的存在。值得注意的是，亲代BA.5.6.2组不包含T22942G突变，该突变于8月初在墨西哥测序的BW.1菌株中首次检测到。

虽然BW.1变异体是Omicron谱系BA.5.6的后代，但其基因组与BQ.x变异体有着共同的进化史。这是因为BW.1和BQ.x都是BA.5血统的后代。

这两个亚变异体都遗传了超过54个突变，包括S:L452R，它与传染性增加相关，赋予峰值稳定性，并促进病毒融合。它们还包含S:F486V突变，它会降低多种单克隆抗体的功效。 

BQ.1和BW.1变异体都含有重要的额外BD突变，包括S:K444T和S:N460K，它们增强了对贝特洛韦单抗（bebtelovimab）的病毒抗性，并阻碍抗体识别，从而实现免疫逃逸。S:N460K突变的存在增强了融合性和对中和的抗性。

结论

研究的作者强调了基因组监测和追踪突变的重要性，这有助于识别对全球产生不利影响的新型冠状病毒株。BW.1毒株极有可能增加世界范围内的新冠病例。

*Important notice

Research Square publishes preliminary scientific reports that are not peer-reviewed and, therefore, should not be regarded as conclusive, guide clinical practice/health-related behavior, or treated as established information.